MN NucleoBond Xtra 系列常见问题
Q:为什么抽到的 plasmid 量不如预期??
A:由于 plasmid 量不如预期的原因非常多,以下为客户常见的问题
a. 请勿直接挑 single colon 至>40ml 的medium 进行培养
如果直接挑 single colony 至>40ml 的medium 中,常常会造成菌体过老而抽不到足够量的plasmid DNA,建议客户先将single colony 放入<5ml 的medium 中先培养6~8hr,再取1/1000 体积的菌液至新鲜的medium 中培养14~16hr (ex: 100ul cultured E.coli + 100ml LB medium),这样的状态下得到E.coli 菌体生产情况较好,得到的plasmid 产量会较高。
b. 操作前一定要测菌体的 OD600 吸光值,确保E.coli lysis 效果
MN 建议high copy 的ODV=400, low copy 的ODV=800(ODV=OD600 xVolume),举例来说,如果OD600=2 的情况下,high copy 菌液量不可超过200ml,low copy 菌液量不可超过400ml。如果菌量超过MN 的建议,造成E.coli lysis 不完全,E.coli lysate 会堵住上方的filter,使得最后的plasmid 产量骤减。
c. 在 NucleoBond Xtra EF 包装中有一瓶标示为70% EtOH,这瓶必须请客户自行加入100%酒精,如果忘了加入EtOH,所有的plasmid DNA 会在wash 步骤中被洗掉。
d. 如果客户使用 Finalizer 进行plasmid 纯化,原厂建议是空压3 次以上将Finalizer 干燥,实验室测试时空压6 次干燥,如果finalizer 不够干,残留的EtOH 会影响后续的elute 效果。
建议客户可以观察 Finalizer 的尖端处,第一次空压时会有EtOH 附着在尖端处,经过几次空压后EtOH 会挥发,当尖端干燥时内部的membrane也会干燥。
Q: NucleoBond Xtra buffer 不够用了,该怎么办??
A:建议客户另外购买 buffer set NucleoBond Xtra buffer set I (#740417) for NucleoBond Xtra,内含RES、LYS、NEU 各150ml,RNase A 10mg NucleoBond Xtra EF buffer set I (#740427) for NucleoBond Xtra EF,内含RES-EF、LYS-EF、RES-EF 各150ml,RNase A 10mg。
Q:NucleoBond Xtra 与NucleoBond Xtra EF 的差异为何??
A:NucleoBond Xtra 与NucleoBond Xtra EF 所使用的column 不同,NucleoBond Xtra 的endotoxin 残留量为<1EU/ug,NucleoBond Xtra EF 的endotoxin 残留量为<0.05EU/ug。
由于这兩组 kit 使用的使用的column 不同,因此包装内的buffer 配方也不同,绝对不可以混用。