OpGen公司宣布与加州大学Davis分校合作开展高分辨率微生物基因组图谱研究
OpGen公司宣布与加州大学Davis分校合作
开展高分辨率微生物基因组图谱研究
上海吉泰远成生物科技有限公司独家代理产品——Argus基因组光学图谱工作站生产厂商OpGen公司12月19日宣布与加州大学Davis分校进行科技合作，共同完成由FDA资助的“十万种基因组计划”，获取高分辨率的微生物基因组图谱。
十万种基因组计划是美国FDA、加州大学Davis分校、安捷伦科技公司共同发起的合作项目，旨在对十万种以上的传染性微生物进行基因组测序，加速食源性传染病的诊断。加州大学Davis分校将把OpGen公司的Argus®全基因组图谱系统（Whole Genome Mapping，WGM，又称光学图谱）整合进他们的DNA测序平台中，来进行测序结果的拼接和验证。
通过整合OpGen公司的全基因组图谱技术，十万种基因组计划将建立高质量微生物参比基因组的新金标准。这些数据将用来监视世界范围内的食源性微生物疫情的爆发，建立一个世界级的精确微生物参比基因组数据库。十万种基因组计划将借助OpGen公司全基因组图谱技术完成测序结果拼接和验证的基因组数据添加到数据库中，供世界范围的公共健康机构获取其中的基因组图谱信息。FDA主张对这个数据库进行严格的质控标准，即数据库中的基因组信息应该采用两种相对独立的方法进行验证。
十万种基因组计划的负责人，加州大学Davis分校Bart C. Weimer教授认为，由“下一代测序技术（Next Generation Sequencing, NGS）”获得的测序片段一般较短，而全基因组图谱技术能够帮助完成这些测序序列的拼接，并对由这些序列拼接进行有效的质量控制；全基因组图谱技术能够检测基因组序列的变异、错配，并帮助补齐测序缺口，是一种独立有效的质控方法；全基因组图谱技术还能够帮助健康机构监控导致重大危害的食源性微生物疫情爆发，保护公众健康。
OpGen公司CEO，Douglas White先生表示，OpGen公司非常荣幸与加州大学Davis分校以及FDA合作，为影响食品安全和公共健康的重要微生物建立高标准的参比基因组验证标准。OpGen公司一定努力为健康机构提供高效的应用信息。
美国疾病预防控制中心估计每年食源性疾病会导致六分之一的美国人（48,000，000人）得病，128,000人住院，3000人死亡。现在已知有包括沙门氏菌、李斯特菌、大肠杆菌和其它病原微生物在内的31种微生物会导致食源性疾病。这其中很多的病原微生物已经被公共健康机构进行跟踪从而监控疫病的爆发。致病微生物的快速检测和鉴定能够有效的进行病原微生物的监控。
关于Argus全基因图谱系统
Argus全基因图谱系统又称Argus基因组光学图谱工作站是一个全新的卡盘式自动化工作平台，依靠OpGen公司独有的基因组光学图谱技术，利用单个基因组DNA分子绘制出高分辨率、有序的全基因组限制性内切酶酶切位点图谱。在不需扩增、PCR、构建克隆或末端配对文库、纯化分离物或特异性基因组纯化试剂等前提下，研究人员就可以对生物的基因组结构、功能、多样性和遗传学进行研究。在强大的MapSolver光学图谱分析软件的辅助下，研究人员可以直观的分析基因组光学图谱，快速地揭示基因组间的相似性和差异性、了解基因组结构和生物间的亲缘关系。对于测序的数据，研究人员可以将叠连群数据以基因组光学图谱为参照快速对重叠群进行排序，大大加速全基因组测序结果拼接效率和准确性，
关于OpGen公司
OpGen公司是唯一提供商业化光学图谱仪器、服务的厂商。光学图谱技术是第一个将菌株分型与测序、表型和基因型相连接的技术方法，可以广泛应用在生物防御，疫情管理，农业和临床微生物学等领域。Argus™基因组光学图谱工作站、 Genomebuilder™软件、MapIt™基因组光学图谱服务能提供有序的来源于单个基因组DNA分子限制性内切酶酶切位点图谱，为生命科学研究完成自动化、高分辨率的比较基因组学、菌株分型和基因组测序序列拼接等研究工作。OpGen公司客户广泛分布在生物防护机构、基因组学研究中心、学术研究机构、临床研究机构和生物技术公司等多个研究和开发机构。
关于上海吉泰远成生物科技有限公司
上海吉泰远成生物科技有限公司是一家专注于生命科学和生物技术领域的高科技企业，是国内代理销售生物试剂、仪器并自主研发生产的知名公司。目前公司已建立起全国性销售、信息、物流网络，总部设在上海，旗下拥有北京、广州、香港三个分公司，十个国内办事处（南京、杭州、成都、武汉、长春、厦门、西安、济南、重庆、天津）。吉泰公司的目标是在生命科学和生物技术领域建成集生产、研究开发和销售于一体的国内外知名的一流企业集团。 吉泰公司代理50多家欧美著名生物技术公司产品，并自主研发生产血清、ELISA试剂盒等产品，销售实验仪器、消耗品、分子生化试剂、免疫试剂和细胞培养试剂等，已被广泛应用于生命科学基础研究、开发应用、制药、疾病诊断与控制、人口与健康、生物技术等诸多领域。客户遍布大学、研究所、医院、卫生防疫、商品检验检疫、制药公司、生物技术公司和食品工业等单位。自2010年起，上海吉泰远成生物科技有限公司成为OpGen公司中国区独家代理商，全线代理OpGen的Argus™基因组光学图谱系统。
详细信息请见：
http://www.opgen.com/news/opgen-announces-partnership-with-university-of-california-davis-to-develop-high-resolution-microbial-genetic-maps-in-support-of-the-100k-genome-project
